Pigmentet organike dhe inorganike dallohen në bazë të origjinës dhe vetive kimike të tyre.
Burimi: Pigmentet organike nxirren ose sintetizohen nga kafshët, bimët, mineralet ose komponimet organike të sintetizuara artificialisht. Pigmentet inorganike nxirren ose sintetizohen nga xehet, mineralet ose komponimet inorganike sintetike.
Vetitë kimike: Molekulat e pigmenteve organike zakonisht përbëhen nga struktura komplekse që përmbajnë karbon, dhe ngjyra e tyre përcaktohet nga struktura kimike e përbërjes organike. Molekulat e pigmenteve inorganike zakonisht përbëhen nga elemente inorganike, dhe ngjyra e tyre përcaktohet nga vetitë dhe struktura e elementeve.
Stabiliteti: Pigmentet inorganike janë përgjithësisht më të qëndrueshme se pigmentet organike dhe më rezistente ndaj dritës, acidit, alkalit dhe nxehtësisë. Pigmentet organike mund të prishen ose të ndryshojnë ngjyrën në kushte të caktuara. Gama e ngjyrave: Për shkak të dallimeve në strukturën e tyre kimike, pigmentet organike në përgjithësi kanë një gamë më të gjerë ngjyrash, duke lejuar ngjyra më të gjalla. Pigmentet inorganike kanë një gamë relativisht të ngushtë ngjyrash. Fushat e aplikimit: Pigmentet organike janë të përshtatshme për ngjyra, bojëra, plastikë, letër dhe fusha të tjera. Pigmentet inorganike përdoren gjerësisht në qeramikë, xhami, pigmente, veshje dhe fusha të tjera.

Duhet të theksohet se si pigmentet organike ashtu edhe ato inorganike kanë avantazhet dhe karakteristikat e tyre, dhe zgjedhja se cili pigment të përdoret varet nga nevojat specifike të aplikimit dhe efekti i dëshiruar.